Пропадают соответствия свойств в записи товаров парсера

в то время когда выполняется настройка соответствий, парсер может быть открыт только у одного пользователя.
как только соответствия настроены, зарывайте парсер и после этого работать могут все остальные пользователя.

Это ограничение было всегда и связано с тем, что это внешняя обработка без изменения конфигурации и нет возможности хранить настройки в каком нибудь справочнике с которым одновременно могут работать несколько пользователей.
Настройки хранятся в едином хранилище и записывать в хранилище можно только какому то одному пользователю в один момент времени.